据埃菲社马德里6月9日报道，西班牙萨拉戈萨大学数学与应用研究所科学家埃内斯托·埃斯特拉达领导的这个项目重点研究新冠病毒的主要蛋白酶。他解释说，这种主要蛋白酶就“像消化系统一样，负责病毒内多种蛋白的转化”。

埃斯特拉达正在研究以方便蛋白酶抑制剂（有机分子、药物或新的化学化合物）攻击这种没有它病毒就无法生存的蛋白酶。

根据该项研究成果，研究人员可以对分子进行大规模检测，找到新冠病毒主要蛋白酶的有效抑制剂，开发出新药。

报道称，新冠病毒主要蛋白酶通常不会像Spike蛋白（S蛋白）那样变化多端，S蛋白是新冠病毒用来进入人体细胞的工具。“这是可以对它进行攻击的优势之一”，埃斯特拉达说，另一个需注意的事项是人体内没有类似的蛋白酶，因此药物的特异性可能非常重要。

埃斯特拉达仔细分析新冠病毒的主要蛋白酶，发现了它与SARS病毒的差异，尽管两者在氨基酸序列上的相似性高达96%。

如果使用标准的数学技术，这些细微的差异是无法察觉的，所以埃斯特拉达必须使用几年前他和他的团队开发的更先进的技术。

埃斯特拉达在网络的数学分析方面颇有经验，因此他将这种蛋白酶视为一张网，以数学方式表示它的结构，将其中303个氨基酸的每一个都视为一个节点，而它们之间的物理互动则用边来表示，由此绘制出一张新冠病毒主要蛋白酶的“蜘蛛网”。

当昆虫掉入蜘蛛网时，蛛网便会产生干扰，告知猎物所在位置。对这些干扰的感觉越灵敏，传播得越远，这个蛛网便越有效。

对比SARS病毒和新冠病毒的“蛛网”，可以发现后者对这些干扰传播的敏感性提高了近20倍，而在细胞内环境中，任何分子间的相互作用都能产生这种干扰。此外，比起SARS病毒的蛋白酶，新冠病毒蛋白酶能够将这种干扰传播得更远。

埃斯特拉达指出，如果落在“蛛网”上的是抑制剂的类似物，那么它会落在一个特定的“位置”，这个位置就是围绕着蛋白酶活动点并发挥蛋白酶功能的一小组氨基酸上。

埃斯特拉达研究了三种抑制剂，其中两种“效果极强”，并发现如果一种抑制剂“对蛋白酶传播干扰的敏感性减少得越多，它对蛋白酶的抑制效果就越好”。

对干扰传播的敏感性越高，蛋白酶作为酶的工作效果就越好，但与此同时它也暴露出有利于抑制剂的致命弱点。